维基百科： 共济会与宗教政治关系
宗 教 方 面
根据章程，共济会所有宗教的成员开放。然而，它从一开始就和很多宗教组织发生了严重的冲突。
天主教
启蒙运动之后的50年里，共济会从英国迅速扩散到欧美，并建立了可以和天主教会相匹敌的巨大组织，对天主教构成了强大的威胁，令教廷十分恐惧。1738年，天主教教宗克勉十二世命令禁止天主教基督徒加入共济会，违反者将被教会开除。在18世纪后半叶教廷一直致力于打压共济会，这可能与意大利大东方共济会积极推动意大利民族统一战争有关，革命领导人加里波第即为共济会员。至今双方的关系仍不怎么样，但一般来说，梵二会议之后天主教会的现代主义成员对于共济会的态度比较友好。
本笃十四世给出了反对共济会的六个原因：
（1）共济会成员的不同信条主义（或者不同宗教信仰）；
（2）他们保守秘密；
（3）他们的誓言；
（4）他们对教会和国家的反对态度；
（5）好几个国家的元首都宣布禁止这个团体的传播；
（6）他们的邪恶行为。
1917年，教会法典明确规定，共济会员将被自动逐出教会。
1983年11月26日，教宗发出声明，重申禁止天主教徒加入一切形式的共济会。
2007年3月2日，梵蒂冈重申反对共济会：“共济会和天主教会的成员是不相容的”，并强调“天主教会一直批评共济会特有的神秘的概念，它的学说与圣经不兼容”。
基督新教
许多的基督教新教教会也反对共济会，原因是共济会接纳多神教思想、认可因做功德而“称义”疏离神等作法严重违反教义。但新教主要派别之一的圣公会则与共济会关系一直比较良好，比如曾经担任第99任坎特伯雷大主教和全球英国圣公会的领导杰弗里·费舍尔（Geoffrey Fisher,1887-1972）就加入了英格兰共济会，而英国共济会会员中，圣公会信徒也不少。
1860年，循理会表示反对共济会和他社会成员的秘密运作，如今还继续禁止其成员加入共济会。浸信会最大的协会分支美南浸信会，最近也表示共济会不符合他们的信念。
NAMB护教学组织即详列比较表指出该会所为与圣经所示诸多警戒相违例如：
禁止拜偶像；“不可为自己雕刻偶像，也不可作什么形像彷佛上天，下地，和地底下，水中的百物。”
禁止起誓；“或有人嘴里冒失发誓，要行恶，要行善，无论人在什么事上冒失发誓，他却不知道，一知道了就要在这其中的一件上有了罪。”
禁止曲解三位一体；“除他以外，别无拯救。因为在天下人间，没有赐下别的名，我们可以靠著得救。”
禁止藉善行抬高自己；“既是出于恩典，就不在乎行为。不然，恩典就不是恩典了。”
禁止乡愿的包含主义；“耶稣说，我就是道路，真理，生命。若不藉著我。没有人能到父那里去。”
共济会大量采用了古埃及、苏美、英国、古印度等地的各种信仰符号，比如共济会的上帝之眼符号起源于苏美人，基督教则视之为异端邪灵、魔鬼撒旦的眼睛；这也是共济会与基督教信仰发生冲突的一个原因。不过在中世纪晚期欧洲兴建的许多大教堂里，也同样有三角形框内独眼放射光芒的装饰图案，是表示教义的三位一体概念。
伊斯兰教
埃及社会事务部颁布决议，于1975年4月18日取缔了埃及共济会。1978年7月埃及开罗的伊斯兰大学学院正式发布了禁止穆斯林加入共济会的命令。然而，许多穆斯林传统的国家如摩洛哥、土耳其和阿尔及利亚还没有在各自的法律中纳入这个教令。伊朗政府多次在各种场合谴责共济会，沙特阿拉伯官方也出版了一些批评共济会的著作。
政 治 方 面
共济会在历史和现在一直受到众多政党和政治组织的反对。共济会名义上要求会员效忠所在国家的政权，不过历史上，奉行天主教为国教的国家是最早对其发展进行阻挠，后来共济会也曾在不同历史时期的沙皇俄国、苏联、德、日本、意大利、被禁止[47]，现代在绝大多数的穆斯林国家和一些非洲国家依然禁止其存在。
君主制国家:在一些君主制国家，共济会因政治原因被禁止。例如在18世纪和19世纪的西班牙。
共产主义者:共产主义者认为共济会是资产阶级的阴谋组织，一直对其持谴责态度。
托洛茨基认为：“共济会是法国共产主义身体上的一个恶性肿瘤，必须用热铁烫掉”。托洛茨基并且要求共产党成员脱离共济会：“隐瞒共济会成员身份的人将被视为渗透特务”。
马克思在其现存的著作里也多达22次谴责了共济会。
列·谢·科洛索夫的著作《克格勃特工记者札记》第六章：《共济会分会内幕》里记载了共产国际禁止其成员加入共济会：1920年7月29日举行的共产国际第六次会议上提交了下面的建议：“加入第三国际的党派应从自己的队伍中开除与小资产阶级组织法兰西‘共济会’有关系的成员。这意味着加入第三国际的同志特别是在西方，没有权利再加入‘共济会’。建议提交者——塞拉吉同志。”
格奥尔金·季米特洛夫本人也警告过“共济会”的危险性，他在1935年至1943年期间一直担任共产国际总书记。他在1943年发表的一篇名为《“共济会”——国际的危害》一文中写道：“民众常常感到不可理解，为什么一些著名的社会活动家毫无理由地完全改变自己的立场……或者只是口是心非，说的一套，而做的是另一套。他们都是以各个‘共济会’分会成员的身份这么做，问题自然就变得简单了。作为‘共济会’的分会会员，这些活动家常常得到相应分会的授意和指令。他们遵守自己分会的纪律，同国家和人民的利益背道而驰。”
中国共产党在取得政权后全国隶属于海外各国共济总会的各地分会在1962年之前全部陆续关闭或迁离到香港，此后国内对于民间结社的管控也比较严格，一直没有能够正式复会。而古巴的共济会则一直存在并得到发展。
纳粹主义者: 1935年8月17日，德国共济会被纳粹解散，原因是认为其是犹太人和金融家高利贷食利者的组织。